Los actuales directivos de la institución fueron denunciados ante la Justicia Federal por el supuesto delito de malversación de fondos, asociación ilícita y presunto lavado de activos, entre otros. La denuncia sostiene además, que se habrían creado empresas de servicios a partir de familiares de los integrantes de la obra social con el solo fin de benefiaciarse con contrataciones directas.